Avec 86% des dépenses de recherche effectuées par ses entreprises. La Franche-Comté est la 1ère région de France pour la place occupée par la recherche privée. Le tissu économique est principalement composé de nombreuses PMI-PME innovantes spécialisées sur des marchés de niche sur lesquels elles développent des savoir-faire à haute valeur ajoutée. Territoire d’innovation, la Franche-Comté est aussi terre d’excellence. Les grands groupes internationaux y ont installé leurs sites « R&D Monde » ou ont développé des stratégies de « centre d’excellence » pour les sites de production franc-comtois. La Franche-Comté, terre de talents et d’innovation cultive et développe des savoir-faire d’excellence particulièrement recherchés.

FAURECIA BAVANS, est le centre mondial de l’équipementier pour la recherche et les essais en matière d’échappements. 150 personnes travaillent au développement des solutions efficaces, économiques.

SCHRADER, en partenariat avec Schrader Electronics, Schrader Pontarlier est le centre mondial du groupe Tomkins pour la recherche et le développement de valves et de systèmes radio-fréquence pour la mesure de pression dans les pneumatiques.

PSA BELCHAMP, le parc de 430 ha abrite les laboratoires, les bancs d’essais et des kilomètres de pistes adaptés à tous types de tests.

SOLVAY, consacre d’importants investissements aux spécialités de la chimie verte et à la maîtrise du risque.

ALSTOM, 3 sites du groupe présents en Franche-Comté sont centres d’excellence mondiaux : 
Alstom transports Ornans, pour la conception et la fabrication de moteurs ferroviaires
Alstom power machines Belfort, pour les alternateurs et les turbines vapeur pour les centrales nucléaires
Alstom Transport Belfort, pour le développement et la fabrication de motrices TGV et locomotives voyaheurs et fret

GENERAL ELECTRIC ENERGY BELFORT, siège européen du groupe, est centre d’excellence mondial de GE pour les turbines à gaz de 40 à 150 mégawatts et plate-forme européenne pour les turbines à gaz de plus de 250 mégawatts.

CRIPS
Ce centre unique dans le Grand Est intervient sur le design du produit en soutien aux industries. La démarche consiste à développer la conception en conciliant fonction et émotion. 

SeT
Ce laboratoire de l’UTBM dispose d’une plate-forme entièrement dédiée à l’intégration du facteur humain dans la conception de produits/process. Au service des entreprises, il permet l’amélioration du confort d’usage des produits, une meilleure ergonomie des postes de travail en cernant et intégrant la dimension humaine ans toutes les étapes de la conception à la fabrication.