La Franche-Comté se place dans le premier tiers des régions européennes, aussi bien pour son effort de recherche que pour sa densité technologique. Les indicateurs de la commission européenne la situent en 3ème position des régions françaises pour la R&D et l’innovation. Recherche et innovation s’inscrivent dans une dynamique favorisée par une coopération territoriale forte et une volonté d’ouverture aux coopérations interrégionales, européennes, internationales. Naturellement orientés par les activités industrielles vers les sciences de l’ingénieur, les laboratoires francs-comtois ont développé des compétences reconnues dans le monde entier dans des champs très spécialisés. La qualité des travaux est souvent reconnue par des distinctions scientifiques au plus haut niveau. La Franche-Comté se distingue également par sa capacité à explorer les domaines des sciences humaines et des sciences de la vie, les innovations tertiaires sont issues de ces disciplines et donnent naissance à de nombreuses start up très prometteuses.

Quelques chiffres...
5ème rang national pour les efforts en matière de recherche
2,1% du PIB franc-comtois sont investis dans la R&D
5 840 personnes travaillent pour la recherche publique et privée
41 unités de recherche
2 757 chercheurs
EFS : 1ère banque de sangs placentaires et 1ère banque de cornée 

> SCIENCES POUR L' INGENIEUR

L’Institut FEMTO-ST fait partie des premières structures labellisées “Institut Carnot”. FEMTO-ST est une entité mixte associée au CNRS et rattachée à l’Université de Franche-Comté, l’Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et de Microtechniques et l’Université de Tefchnologie de Belfort-Montbéliard. La recherche est menée dans les domaines des sciences de l’ingénieur et des sciences de l’information. FEMTO-ST est impliqué dans plusieurs laboratoires communs en France et à l’étranger, que ce soit avec des industriels comme le laboratoire commun LPMX et des organismes de recherche comme l’insttitut FC LAB, le laboratoire américain Georgia-Tech, le LEA microtechniques, le laboratoire franco-japonais LIMMS.

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LERMPS, laboratoire d’Etudes et de Recherches sur les Matériaux, les Procédés et les Surfaces. 70 personnes mènent des travaux sur des équipements industriels performants notamment pour la conception et l’élaboration de matériaux et de revêtements précurseurs, et leur caractérisations.

FC LAB, basé à Belfort, le FC-Lab est un complexe qui développe des piles à combustible et regroupe 7 organismes dont 3 universités, le Commissariat à l'Energie Atomique et le CNRS. Les objectifs sont centrés sur l’intégration, la durabilité et la fiabilité des systèmes à piles à combustibles.

SeT - Laboratoire Systèmes et Transports, regroupe des compétences en automatique, informatique, énergie, ergonomie autour des transports terrestres et de la mobilité. Il dispose de deux plate-formes de réalité virtuelle de véhicules et maquettes pour la simulation, la conception de produits, la commande intelligente et la gestion d’énergie.

> SCIENCES DE LA VIE / SCIENCES HUMAINES ET SOCIALES

IFR 133 - Institut fédératif de recherche, ingénierie et biologie cellulaire, 10 équipes de recherches dans la santé et la biologie sont impliquées dans des travaux collaboratifs avec l’Institut FEMTO-ST, le pôle des Microtechniques et/ou des entreprises du monde industriel.

EFS - Etablissement français du sang, il est l’une des plus importantes structures de bio-ingénierie en France.

L'EFS Bourgogne/Franche-Comté
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CHRONO-ENVIRONNEMENT : Depuis le 1er janvier 2008, ce laboratoire regroupe les laboratoires de biologie environnementale, de chrono écologie et de géosciences. Il réunit en un programme de coopération pluridisciplinaire les spécialistes pour étudier l’effet sur les milieux naturels de la présence de l’homme. Ils appliquent leurs compétences aux questions de sécurité sanitaire et environnementale.

MSHE : La Maison des Sciences de l’Homme et de l’Environnement, réunit les laboratoires et équipes des Sciences Humaines et Sociales des 2 universités de Franche-Comté et développe des recherches interdisciplinaires en intelligence territoriale, sur la transmission des savoirs, sur l’identité, sur l’analyse numérique et statistique des textes, sur les rapports entre l’Homme et l’environnement.

THEMA, théoriser et modéliser pour aménager, le laboratoire développe des recherches dans le domaine de l’analyse spatiale et la géomatique appliquée aux transports.

ISBA : l’ENIL de Mamirolle et l’ENILBIO de Poligny se sont fédérées pour créer l’Institut des sciences, des biotechnologies de l’agroalimentaire de Franche-Comté. L’ISBA est le support de recherche appliquée dans les domaines des technologies laitières, la caractérisation de produits agroalimentaires, la mise au point de nouveaux cahiers des charges, les expertises et audits technologiques.