Structure fédérative créée en 2001 et portée par le CNRS et les Universités de Franche-Comté - UFC - et de Technologie de Belfort-Montbéliard - UTBM, la MSHE franc-comtoise a été intégrée au réseau national des MSH dès 2004.

Elle pour objectif de valoriser les compétences des laboratoires et équipes SHS - Sciences de l’Homme et de la Société - de Franche-Comté et de leur donner la possibilité de renforcer leurs partenariats aux plans national et international.

Ces équipes représentent un très large éventail de disciplines : Archéologie, Archéométrie, Biostatistiques, Droit, Ecologie, Economie, Epidémiologie, Géographie, Géosciences, Histoire, Linguistique-Sciences cognitives, Littérature, Sciences du Paléo-environnement, Philosophie Psychologie, Santé publique, Sociologie-Anthropologie… Un des objectifs de la MSHE étant de favoriser la pluridisciplinarité au sein des équipes de SHS.

Unité mixte de service et de recherche, sa programmation scientifique se structure en quatre pôles de recherche interdisciplinaire :

1. Dynamiques territoriales

2. Transmission et identité

3. Archives, bases, corpus

4. Homme et environnement

Ces pôles s’articulent selon différents axes eux-mêmes déclinés en actions.

La MSHE Ledoux dispose également d’une plateforme technologique mutualisant les ressources scientifiques pour les mettre à disposition de la communauté des chercheurs SHS francs-comtois : équipements spécialisés et outils informatisés, compétences méthodologiques et technologiques, connaissances et informations scientifiques numérisées…